Logo com a chegada da corte portuguesa, foram formadas as primeiras escolas de educação superior na colônia. Em 1808, a escola de Cirurgia e Anatomia em Salvador (atual faculdade de medicina da UFBA) e, no Rio de Janeiro, a escola Anatomia e Cirurgia (atual faculdade de medicina da UFRJ) e a Academia da Guarda Marinha. Em 1810, foi criada a Academia Real Militar, também no Rio de Janeiro. Quatro anos depois, surgiram também o curso de Agricultura e a Escola Real Academia de Pintura e Escultura. Em 1792 já haviam sido fundadas algumas escolas profissionalizantes, que posteriormente foram usadas como base para as escolas criadas com a chegada da família real.
